Genau, es gibt jetzt 2 MetadataModifier.
Einmal einen, der sozusagen die allgemeine Metadata beinhaltet, wie den CustomName oder die Gravity.
Der andere baut darauf auf und stellt zusätzliche, für die ArmorStands benötigte, Funktionalitäten bereit.

Die Displays nutzen den allgemeinen Modifier, da eben z.B Änderungen an einer BasePlate irreführend sind.

Aus meiner Sicht sind die folgenden Alternativen denkbar:

• Wir nennen den ArmorStand MetadataModifier um
• Wir entfernen den MetadataModifier vollständig und teilen den Inhalt auf mehrere, spezifischere Modifier auf (z.B CustomNameModifier)

Ich würde die Modifiers, die zum FakeArmorstand gehören, zu den anderen modifiers der Displays verschieben. Falls NPC auch noch modifiers hat, dann die ebenfalls.
Und dann würde ich den aktuellen MetaDataModifier von den FakeArmorStands zu ArmorStandModifier umbenennen